-Bileşik enzimlerde apoenzime ek olarak bir de yardımcı kısım bulunur. Bu yardımcı kısıma kofaktör adı verilir. Kofaktör organik ya da inorganik moleküllerden oluşabilir. Organik moleküllerden oluşan kofaktöre koenzim adı verilir. B grubu vitaminlerin çoğu koenzim olarak işlev görür. Kofaktörler Fe+2, Mn+2 gibi inorganik yapılı da olabilir.
- Enzimde işlev gören esas kısım burasıdır. Bileşik enzimlerde apoenzim veya koenzim-kofaktör kısımları yalnız başına etkin değildir. Koenzim ya da kofaktörle birleşmiş aktif enzim yapısına holoenzim adı verilir.
-Verilen bilgilere göre bu üç molekülün yapısal ortak bir özellikleri yoktur.
-Apoenzin ve koenzim kısmı organiktir. Kofaktör organik de olabilir inorganik de olabilir. Organik ise koenzim, inorganik ise kofaktör olarak adlandırılır.